本书分内容主要包括：人体生理处、病理处、对治处、治病处、医生处等五种钥匙；诊断法、寒热关键辩证、治法、平息疗法、下泄疗法、外治法等的六秘诀要点；妇科病、小儿病、男科病、养老病、隆赤培根病、寒病、热病、五官病、皮肤病、脉筋病、脏腑病、杂病、邪魔病、中毒症、创伤等的十六则疗法。

《医学关隘神奇钥匙(藏文版)/藏医药经典文献集成》目录为藏文（略）