本教材按照器官系统整合原则，将医学微生物学和人体寄生虫学的内容进行有机整合。总论强调病原体及感染的总体概念，各论则按病原体的进化程度从低级到高级（非细胞型微生物、原核细胞型微生物、真核细胞型微生物、人体寄生虫）设置章节，更有利于学生对各种病原体的生物学地位、特性、致病性和防治的理解。教材的编写结合临床医学专业的教育标准，在强调病原生物学基本知识的同时，注重创新思维的培养，突出基础理论与临床相结合。